O sistema de bypass permite a derivação de volumes de escoamento superiores ao caudal máximo admissível pelos separadores garantindo o seu bom funcionamento.
Os separadores de hidrocarbonetos com bypass são usualmente aplicados em zonas com elevadas superfícies impermeabilizadas e por consequência sujeitas a picos de caudal pluviais importantes decorrentes de fenómenos de forte precipitação.